El plan de estudios de Doctorado en Ciencias cubre 164 créditos SATCA (Sistema de Asignación y Transferencia de Créditos Académicos) distribuido en 8 semestres en: Proyectos de Investigación (96 créditos), Seminario de Investigación (16 créditos), Seminario Predoctoral (8 créditos), Examen Predoctoral (8 créditos) y Tesis (52 créditos) y está diseñado para obtener el grado de Doctor en Ciencias en 48 meses.
El plan de estudios se divide en 8 semestres, mismos que se encuentran estructurados de acuerdo al siguiente mapa curricular: