El plan de estudio del programa de Doctorado en Ciencias en Ingeniería Mecánica del CENIDET ha sufrido distintas etapas de evaluación y actualización. La ante-penúltima actualización tuvo lugar en el año 2005 con vigencia en el SNEST a partir de Agosto 2006. El programa quedo con clave DIME-2005-22, el cual sustituyo al programa con clave DIM-1994-001. En esta actualización, el contenido del plan de estudios fue modificado y se determinó que únicamente sería de orientación hacia la investigación. También, se estableció que cada dos cuatrimestres se evaluaría el avance del alumno con un informe escrito y una presentación oral frente a su comité tutorial. La siguiente actualización de Planes y Programas de Estudio dio inicio en el año 2009 con el objeto de realizar un diagnóstico de la situación académica de dicho plan (reuniones en el IT de Boca Río, de Cancún, de Celaya y de León), por otro lado, el conocimiento requerido para el desarrollo y consolidación de las líneas de investigación fue determinado en reuniones con docentes de la SNEST, las cuales se celebraron en el año 2010 en los IT de Orizaba, de Cd. Guzmán, de Ciudad Madero y Veracruz. Como resultado se obtuvo un conjunto de asignaturas por áreas de conocimiento denominado catálogo general de asignaturas (CGA). También, esta penúltima actualización tuvo como objetivo fundamental homologar todos los programas de posgrado de una misma área, con el objeto de facilitar el intercambio académico y el que estudiantes de posgrado puedan realizar estancias en instituciones diferentes sin alteraciones de su programa de estudios. El nuevo plan de estudios entró en vigor en Agosto de 2010, el plan de estudios doctoral cambió de ser un programa de estudios cuatrimestral a semestral y de periodo de 3 a 4 años de duración. El plan de estudios actual consta de la acreditación de 164 créditos para obtener el grado de Doctor en Ciencias en Ingeniería Mecánica. La clave del actual programa doctoral es DIME-2010-04. En Junio del 2015, se re-estructuró el mapa curricular, se mantuvo el número de créditos y de materias, la re-estructuración consistió en la asignación de fechas en la cual se deben presentar los eventos académicos: seminario y examen predoctoral con la finalidad de reducir los tiempos de graduación y mejorar la eficiencia terminal.
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